تاثیر محیط برعملکرد فنوتیپی حیوانات و تقابل ژنوتیپ و محیط از یک سو نیاز به زمان طولانی جهت دستیابی به اطلاعات فنوتیپی دارد، از سوی دیگر مانع مهمی در راه دستیابی سریع به اهداف اصلاح نژادی بوده است. امروزه انتخاب ژنومیک به دنبال یافتن توالی دقیق همه ژنوم موجودات و کمک به فهم عملکرد ژنها و تعامل آنها با هم و محیطی که در آن قرار دارند میباشد. در اصلاح نژاد منظور از ارزیابی ژنومیک، استفاده توأم از اطلاعات ژنوتیپی در حد توالی DNA ، به همراه اطلاعات فنوتیپی است که بتوان بدون نیاز به زمان طولانی، جهت آشکار شدن عملکرد فنوتیپی .] حیوانات را رده بندی کرده و افراد مطلوب را انتخاب نمود ]بهمرام و سید شریفی 1171 کشف نشانگرهای SNP و پیشرفتهای به دست آمده در ژنتیک مولکولی وکشف روشهای نوین توالییابی کل ژنوم موجودات زنده و پیشرفت روشهای بیوانفورماتیک و دانش رایانه ای و... حجم بسیار زیادی از داده های مولکولی را فراهم آورده و در علم ژنتیک شاخهای به نام ژنومیک ایجاد کرده است. در گزینش ژنومیک هر یک از نشانگرها به عنوان یک عامل تصادفی یا کواریت وارد مدل می شود و ارزش اصلاحی افراد از مجموع ارزش اصلاحی نشانگرها برآورد میگردد. هدف از انتخاب ژنومی استفاده همزمان از دادههای ژنوتیپی در سطح توالی DNA به همراه دادههای فنوتیپی است، تا بتوان بدون نیاز به صرف زمان و هزینههای زیاد دامها را ارزیابی کرده و دامهای بهینه را گزینش نماید. در گاو، گوسفند و خوک حدود 11111 عدد SNP به صورت تجاری در دسترس است. محدودیتهای انتخاب ژنومی یکی تعداد زیاد نشانگرهای مورد نیاز و دیگری هزینه بالای ژنوتایپینگ میباشد که این دو مشکل در اکثر گونه های دامی به
دنبال طرح های توالی یابی ژنوم و شناخت حدود صدها هزار SNP همراه با پیشرفت در فناوری ژنوتایپینگ بر طرف شده است