یجاد و گسترش هر بیماري عفونی در میزبان شامل مراحل پیچیـدهاي از ارتبـاط متقابل بین میزبان و میکروب میباشد. وقایع کلیدي در جریـان ابـتلا بـه عفونـت شامل ورود میکروب به بدن و تهـاجم و تجمـع در بافـتهـاي میزبـان، گریـز از پاسخهاي ایمنی و بالاخره ایجاد آسـیب بـافتی و یـا اخـتلال در فعالیـت طبیعـی بافتهاي میزبان میباشد. بیماریزایی باکتریها معمولا بـه دو صـورت کلـی صـورت میگیرد، یکی خود حمله و گسترش باکتري و دیگري ترشح سموم. معمولا هر دو بازوي ایمنی ذاتی و اکتسابی در مقابل باکتریها به دفاع میپردارنـد. ایمنی ذاتی – خط اول دفـاعی و ایمنـی اکتسـابی در خـط دوم دفـاع قـرار دارد. بعضی از باکتریها که از خط اول دفاعی یعنی ایمنی ذاتی فرار مـیکننـد در چنـگ ایمنی اکتسابی گرفتار میشوند. بعبارتی ایمنـی اکتسـابی بـه کمـک ایمنـی ذاتـی میشتابد. ایمنـی اکتسـابی و ذاتـی بـه صـور مختلـف بـدفاع در مقابـل باکتریهـا میپردارند. بقا یا بیماریزایی میکروب ها در میزبان تحت تاثیر توانایی و یا مقاومت میکروبهـا از ساز و کارهاي حفاظتی میزبان میباشد. عفونت زایی تعادل بین حمله میکروب ودفاع میزبان است یعنی یک مبارزه بین میکروبهاي بیمـاریزا و میزبـان بـراي بقـا وجود دارد. در بعضی از عفونت ها، آسـیب بـافتی ناشـی از خـود میکـروب بـه تنهایی نیست، بلکـه ناشـی از پاسـخ میزبـان علیـه میکـروب و فـراوردههـاي آنمیباشد. باکتریها را در یک نگاه کلی به دو دسته خارج سـلولی و داخـل سـلولی تقسیم میکنند که دفاع متفاوتی در مقابل آنها بوجود میآید.

بيماری تب برفکی یک بيماری بسيار عفونی و بشدت واگير دام می باشد که به لحاظ شدت خسارات اقتصادی یکی از موانع اصلی در تامين بهداشت و توليد دام و فراورده های دامی محسوب ميگردد. این بيماری سبب کاهش شدید توليد دام شده و نقش اساسی در تجارت دام و از جمله مهمترین بيماریهای مسری گاوان FMD . فراورده های خام دارد است که باعث خسارات اقتصادی قابل توجهی ميگردد. در گاوان بالغ احتمال کشندگی آن کم است اما در اثر ایجاد ميوکاردیت در کم سن و سال ها کشندگی بالایی دارد.تقریباً تمامی دام های زوج سم از جمله گونه های نشخوارکنندگان اهلی نظير گاو، گاوميش، گوسفند و بز مورد هدف ویروس عامل بيماری قرار می گيرند. شدت واگيری در دامهای حساس بسيار بالا ( % ١٠٠ ) بوده ولی ميزان مرگ و مير پائين و عمدتاً دام های جوان را در برمی گيرد.
ویروس عامل بيماری از جنس پيکورنا ویروسها بوده که در این جنس ٧ SAT و سوشهای آفریقائی و ٣ Asia ١ – C – A – O سروتایپ بنام هایقرار دارند. ماهيت این ویروس که از نوع – SAT ٢ – SAT ١یروس RNAمی باشد، تغييرات شدید آنتی ژنتيکیAntigenic Variantsاست کههمواره در مناطقی که بيماری به فرم آندميک حضور دارد، سبب پيدایش دیگری چرخش ویروس در جمعيت های دامی دارای سطوح ایمنی متفاوت ناشی از ناهمگونی و همزمان نبودن مایه کوبی در آنهاست که شرایط ایجاد موتاسيون را برای ویروس فراهم می سازد. بيشترین زمينه A در بين ویروسهای ٧ گانه بيماری تب برفکی، تيپتغييرپذیری و ایجاد واریانت های جدید را از خود نشان داده و در سالهای تب برفکی در ایران علاوه بر تيپ A اخير حداقل ٣ واریانت تائيد شده از تيپ] A که سالها از ثبات بيشتری برخوردار بوده شناسائی گردیده است A٢٢ A ٩٦ این تحت سویه از سوی موسسه رازی تحت عنوان ٢٠٠ – A٩٩ ( و O سایر تيپ های ویروس از جمله ) A شناسائی و نام گذاری گردید. ٨٧ تغيير پذیری کمترو محدودتری دارند) . Asia Iاگر چه در بين آنها برخی حدت زیادتر و برخی حدت کمتری دارند و بدین لحاظ در زمان استفاده از ویروس های جدا شده، حدت و شدت بيماریزائی آنها بایستی کنترل و همواره ویروسی در واکسن بکار گرفته شود که در بين ویروسهای شایع، بيشترین حدت بيماریزائی را داشته باشد

ماهی تیلاپیا یکی از مهمترین گونه هاي پرورشی آبزیان در جهان بوده و نقش مهمی در اقتصاد شیلاتی بسیاري از کشورها دارد. بهدلیل وجود خصوصیات ویژه اي از جمله امکان سازگاري با محیط جدید، تولید مثل سریع و رشد مناسب در بیش از 100 کشور جهان بهعنوان ماهی پرورشی پذیرفته شده است. در این میان وجود بیماريهاي مختلف عفونی از جمله بیماريهاي باکتریائی و ویروسی بهدلیل بروز تلفات گسترده و ایجاد خسارات اقتصادي قابل توجه، یکی از چالش هاي اساسی در روند توسعه آبزي پروري این گونه مهم محسوب میگردند. مطالعات محققین مطرح بر روي بیماريهاي ماهی تیلاپیا ثابت کرده 1هفته) پس از معرفی بچه ماهیان به استخرها، احتمال آلودگی به انواع باکتريها و انگلها - استکه در زمان کوتاهی ( 2 (منوژنها و تک یاختهها) افزایش مییابد، همچنین آلودگی به ایریدو ویروسها موجب تلفات سنگین ماهیان در ابتداي دوره پرورش میشود. بیشترین خطر تلفات ماهیان در اواسط و اواخر دوره پرورش ناشی از وجود باکتريهاي بیماريزا نظیر گونههاي ،Streptococcus استرپتوکوك ها ،Aeromonads و به ویژه آئروموناس ها Flavobacteriums فلاووباکتریومهامیباشدکه در صورت عدم رعایت نکات ایمنی و اصول بهداشتی میتوانند (S.agalactiae) و (S.iniae) ،(S.dysgalacti) موجب سپتی سمی، مننگوآنسفالیت، کاهش اشتها، لاغري، بی حالی، خونریزيهاي منتشره جلدي واندامهاي داخلی، اگزوفتالمی،شناي مارپیچی و زمینه ابتلا به بیماريهاي توام با مرگ و میر را ایجاد نمایند. بیماريهاي ویروسی ماهیان تیلاپیاي پرورشی از اهمیت بیشتري برخوردار بوده و میزان ابتلا و مرگ و میر به سن، درجه حرارت آب و دیگر شرایط پرورشی بستگی دارد؛ از در دوره لاروي، همچنین بیماري ایریدو ویروسی Herpes-like virus جمله درکشورهاي پیشرو، برخی هرپس ویروسها
این صنعت را با (VNN) یا Viral Nervous Necrosis و بیماري نکروز عصبی ویروسی Iridoviral disease (IVD) تهدیدهاي جدي در دنیا مواجه نمودهاند.