عفونت دیده به دلائل حلالیتی: از سدهای مهم بدن میتوان به سد خون مغز، سد خونیبا مایع نخاعی اشاره کرد که در درمان بافتهای عصبی حائز اهمیت هستند. ولی همواره
نمیتوان حضور سد های خاصی را برای درمان در نظر گرفت مثلا در دستگاه تنفسیسدی بین عروق وبافتهای تنفسی وجود ندارد ولی برخی داروها نظیر اریترومایسین یا
پنی سیلین در این بافت غلظت بیشتری ایجاد میکنند یا آمینوگلیکوزید ها با دلیلپلیکاتیونیک بودن به بافت کلیه و همچنین گوش میانی تمایل بیشتری نشان داده و در
این بافتها غلظت زیادی پیدا میکنند لذا در هنگام درمان این قبیل بافتها انتخاب اینپادزیستها میتواند یک مزیت محسوب شود.
2 -غیر فعال شدن دارو در محل عفونت:
سولفانامیدها و آمینوگلیکوزیدها در حضور بافتهای نکروتیک و چرک غیر فعال میشوندرژیم درمانی نا مناسب: دز درمانی نا مناسب یا دوره درمانی کوتاه می توانند باعث
ناکارآمدی درمان ضدمیکروبی و پس از آن احتیاج به تکرار درمان شود همچنین راه تجویزمناسب نیز میتواند در به نتیجه رسیدن درمان موثر باشد چراکه اگر مثلا برای دامی راه تجویز
تزریقی در نظر گرفته شده باشد ولی صاحب دام امکان چنین تجویزی را به درستی و در زمانمعین میسر ننماید مطمعنا در مان با موفقیت همراه نخواهد بود و این درحالیست که اگر راهتجویز مناسبتری انتخاب شده بود درمان نیز میسر میشد.
4 - درگیری به بیماریهای همزمان: در زمان درگیری به بیماریهای ویروسی به طور کلیاستفاده از درمانهای ضد میکروبی میتواند بی اثر باشد و باید در تجویز درمانهای ضد میکروبی
در زمان درگیری به چنین بیماریهایی از مناسب بودن زمان درمان اطمینان حاصل نمود5 -پاسخ ایمنی نامناسب:
6 - بروز مقاومت به پادزیستها: این مورد میتواند حتی در زمانی که تست های آنتی بیوگرامبرای دارویی مثبت نشان داده شده است اتفاق افتد و دلیل آنرا میتوان وجود ژن مقاومت در
باکتریهای موجود در جمعیت فلور دانست که در زمان انجام تست ظهور فنوتیپی نداشته اند.