زبان خود را انتخاب کنید

pdf شناسایی محاسباتی فاکتورهای تنظیمی مؤثر در بیماری برونشیت عفونی طیور با استفاده از داد ه های RNA-Seq محبوب

توسط در مقالات حوزه دام و طیور و کشاورزی Tagged in بیان_ژن, شبکه_تنظیمی, فاکتورهای_رونویسی, پروموتر 2400 دانلود

دانلود (pdf, 729 KB)

برونشیت عفونی.pdf

بیماری برونشیت عفونی یکی از بیماری های ویروسی بسیار عفونی و شایع طیور م یباشد. در اين مطالعه به منظور درك بهتر شبكه تنظيمی درگير در بیماری برونشیت عفونی، در ابتدا ژن های با بيان بالا و مشابه با استفاده از تجزيه و تحليل داده های یک مطالعه RNA-Seq در چهار حالت متفاوت شامل مقایسه ی بافت طحال جوجه های مبتلا به برونشیت با جوجه های سالم با غلظت پایین سرم مانوز باند شده با لکتین در سن یک هفتگی و سه هفتگی و مقایسه ی بافت طحال جوجه های مبتلا به برونشیت با جوج ههای سالم با غلظت بالای سرم مانوز باند شده با لکتین در سن یک هفتگی و سه هفتگی شناسایی شد. سپس توالی پروموتری اين ژ نها جهت شناسايی فاكتو رهای رونويسی کاندید درگیر در این مکانسیم استخراج شد. نتایج تجزیه و تحلیل پروموتری با استفاده از نرم افزار Genomatix منجر به شناسایی 61 فاکتور رونویسی کاندید جدید احتمالی مؤثر در مراحل تنظیمی برونشیت عفونی گردید. افزون بر این، به منظور مصورسازی شبکه های تنظیمی شامل فاکتورهای رونوویسی که ژن های مورد نظر را تنظیم می کنند از نرم افزار Cytoscape استفاده شد. بر اساس نتایج، 61 فاکتور رونویسی کاندید جدید معرفی شده در این مطالعه دارای پتانسیل مناسبی برای بررسی بیشتر در سطح آزمایشگاهی م یباشند و می توانند اطلاعات جدیدی را در درک بهتر شبکه ی تنظیمی مؤثر در بیمار برونشیت عفونی طیور فراهم کنند.