زنجيره هاي پلي پپتيدي سنگين و سبك مولكولهاي ايمونوگلبولين بصورت حلقه هائي در مناطقي بنام حـوزه (Domain(بـر روي خود بطورفشرده و كروي مانند (Golbular (چين خورده اند بطوري كه اين حوزه ها بوسيله قطعات كوتاه اسيدهاي آمينه از ( 3 اسـيد آمينـه خـتم مـي شـوند بنـام ازت انتهـائي + يكديگر مجزا شده اند.يكطرف اين زنجيره هـا كـه بـه عامـل آمـين NH( ( منتهـي ميـشوند بنـام كـربن انتهـائي (Terminal-C) - (Terminal-N (و طرف ديگر كه به عامـل كربوكـسيل COO( نامگذاري شده است. زنجيره هاي سنگين و سبك مولكول ايمونوگلبولين بوسـيله پيونـدهاي اشـتراكي (Covalence (داراي دو عامل سولفيدي(bonds S-S Interchain (و همچنين پيوندهاي غيراشتراكي به يكديگرمحكم متـصل ميباشـند. پيونـدهاي دوگانة سولفيدي (Intrachain (بعلاوه تشكيل حلقه هاي پپتيدي (Loop (در هر حوزه (Domain (مولكول ايمونوگلبولين را ميدهند.حوزه هاي پپتيدي زنجيره هاي سنگين وسبك كه درناحيه ازت انتهائي واقع شده اند و در ارتباط و يا تماس مـستقيم بـا آنتي ژن هستند،مناطق متغير(regions Variable (يا V نامگذاري شده اند. علت اين نام اينـست كـه منـاطقي از اسـيدهاي آمينه اين حوزه ها درمولكول ايمونوگلبولين ثابت نيستند و براي هرآنتي ژن متغير ميباشند.اين مناطق بسياركوچك پپتيـدي درايـن حوزه را كه اسيدهاي آمينه آن ثابت نيـستنددراصطلاح منـاطق بـسيارمتغير((HV(regions Hypervariable (يـا منـاطق .گويند مي) Complementarity determining region (CDR) مكمل بوسيله روش كريستالوگرافي يا اشعه ايكس نشان داده اند كه اين مناطق بسيار متغير در تماس مستقيم با آنتـي ژن هـستند .از آنجائي كه هر واحد ساختماني (Subunit (مولكولهاي ايمونوگلبولين از دو زنجيرة سنگين و دو زنجيرة سبك درست شده اسـت، بنابراين هر واحد داراي دو حوزة متغير در زنجيره هاي س نگين (VH (و دو حوزة متغير در زنجيره هاي سبك (VL (كه هر جفـت VHو VL روبروي هم قرار دارند (شكل شماره 3-2 . (از طرف ديگر ، اسيدهاي آمينه ساير حوزه هاي مولكولهاي ايمونوگلبـولين كمتر متغير و نسبتاً ثابت هستند و به همين دليل آنها را مناطق ثابت (regions Constant (يا C مي گويند. تعداد حوزه هـاي اين مناطق در زنجيره سنگين هر واحـد سـاختماني مولكولهـاي IgG ،IgA و IgD سـه جفـت ودر مولكولهـاي IgM و IgE چهارجفت كه هر حوزه را بصورت CH1 ،CH2 ،CH3 و CH4 نشان مي دهند. حوزه هاي ثابت(C (در زنجيره هاي سبك كاپا و لامبداي هر واحد ساختماني ايمونوگلبولين يك جفت مي باشد كه هر كدام را بصورت CLنشان مي دهند. در هر واحد ساختماني ايمونوگلبولين حوزه ثابت CH1 در مقابل CL قرار دارد ولي بقيه حوزه هاي زنجيرة سنگين، قرينة يكديگر قرار گرفته اند. محلـي را كه ناحيه متغير(V (به ناحيه ثابت(C (متصل ميشود منطقة كليد(region Switch (ميگويند.هر حلقه پلي پپتيدي (Loop( زنجيره هاي سنگين و يا سبك از 60 تا 70 اسيد آمينه و هر حوزه (Domain (از حدود 110 اسيد آمينه تشكيل شده است. تشابه ساختماني بين مولكولهاي ايمونوگلبولين وهمچنين گيرنده هاي آنتي ژن در سطح cells-T ،كلاس1و 2 آنتي ژنهـاي اصلي سازگاري نسجي(MHC (وهمچنين بسياري ازمولكولهاي چسبنده وگيرنده هاي سطحي سـلولهاي سيـس تم ايمنـي وجـود دارد. ساختمان اين مولكولها، همگي از به هم پيوستن اسيدهاي آمينه بصورت حلقه هايي مانند ايمونوگلبولين تشكيل شـده اسـت . بنابراين اين دسته پروتئينها را بنام خانوادة ابر ژن ايمونوگلبولين (family Supergene-Ig (نامگذاري كرده اند. حوزه هاي متغير زنجيره هاي سنگين و سبك مولكول آنتي بادي، روبروي يكديگر حفره يا شكافي (Pocket (را درست مـي كنند كه قالبي براي يك اپي توپ آنتي ژن است. گنجايش اين حفره به اندازه يك اوليگوساكاريد 6 تا 7 قندي و يا پپتيدي از 4 تـا 7 اسيد آمينه مي باشد. مناطق بسيار متغير يا مكمل (CDR (در زنجيرة سنگين و سبك بنحوي روبروي يكديگر قـرار دارنـد كـه كاملاً در تماس مستقيم با آنتي ژن هستند و يك اپي توپ را در بر مي گيرند . بعلاوه شكل فـضائي كـروي ماننـد (Globular( مولكول ايمونوگلبولين و چين خوردگيهاي فشرده حوزه ها در بوجود آمدن اين حفره كمـك مـي كننـد . از آنجـائي كـه هـر واحـد ساختماني مولكول آنتي بادي از دو زنجيـرة سنگين و دو زنجيرة سبك تشكيل شده، بنابراين تعـداد ايـن حفـره هـا -Antigen( (sites combining در هر واحد ساختماني ايمونوگلبولين ، دو تا مي باشد كه هـر دو يكـسان و بـراي يـك اپـي تـوپ معـين اختصاصي (Specific (است. به اين حفره ها در اصطلاح پاراتوپ (Paratope (نيز مي گويندو مانند قفلي براي كليد آنتي ژن اختصاصي مي باشند.چين خوردگيها وفشردگي زنجيره هاي پلي پپتيدي مولكول آنتي بادي در فاصله بين دو حـوزه كمتـر اسـت و بهمين علت حد فاصل بين حوزه ها حساسيت بيشتري نسبت به آنزيمهاي هضم كننده دارند.