از نظر تكامل زيستي (Phylogeny ، (پروتئينهاي راه آلترناتيو قبل از راه كلاسيك درجانداران بوجود آمده اند.فعال شدن راه آلترناتيو سيستم كمپلمان، بدون دخالت آنتي بادي بصورت دفاع غير اختصاصي يا ذاتـي (Innate (مـي توانـد بعـضي ازباكتريهـا، ويروسها و سلولهاي سرطاني را از بين ببرد. فعال كننده ها (Activators (يا موادي كه راه آلترناتيو سيستم كمپلمان را فعال مـي كننـد ماننـد راه كلاسـيك شـامل دو دسته اند: الف – فعال كننده هائي كه منشاء ايمونولوژيك دارند. ب – فعال كننده هائي كه منشاء غير ايمونولوژيك دارند. الف- فعال كننده هائي كه منـشاء ايمونولوژيـك دارنـد بـه دو شـكل سيـستم كمپلمـان را از راه آلترنـاتيو فعـال مـي كننـد . ايـن ايمونوگلبولينها شامل IgA ،IgG4 و IgE مي باشند. 1 .كمپلكسهاي ميكروب يا آنتي ژن با آنتي بادي كلاسهاي IgA ،IgG4 و IgE بصورت مجموعه هـاي ايمنـي كـه در نتيجة واكنشهاي ايمني ميزبان تشكيل مي شوند. 2 .مولكولهاي پليمر و بهم متصل اين ايمونوگلبولين ها (Aggregated . ( 2 )لازم اسـت. يـاد آوري / قطعة Fc اين ايمونوگلبولين ها نقشي در فعال شدن راه آلترنـاتيو نـدارد ولـي وجـود قطعـة ab(F مي شود كه شدت واكنشهاي راه آلترناتيو از كلاسيك بسيار كمتر است. ب – فعال كننده هائي كه داراي منشاء غيـر ايمونولوژيـك هـستند . ماننـد آنزيمهـاي شـبيه تريپـسين، ليپـوپلي سـاكاريدها، پلـي ساكاريدهاي گياهي و باكتريـايي، اندوتوكـسين باكتريهـاي گـرم منفـي، فـاكتور سـم مـاركبري Factor Venum Cobra( (CVF ، (فاكتور نفريتيك (C3Nef ،(زيموزان ديوارة سلولي مخمرها، برخي از انگلها و ويروسها، سلولهاي آلوده بـه ويـروس و سلولهاي سرطاني